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生命科学学院孔道春实验室在真核细胞DNA复制起始机制研究方面取得突破性发现

DNA复制的研究已经历了三个主要阶段:第一阶段是20世纪50年代到70年代末,主要是研究原核细胞DNA复制叉里的生化反应,包括复制蛋白/酶的确定及它们生化作用的阐明;第二阶段是60年代末到80年代末,主要是确定真核细胞DNA复制叉里蛋白/酶及阐明它们的生化作用;第三阶段是研究真核细胞DNA复制起始机理,这个阶段从上个世纪80年代末开始,一直到现在。为什么真核细胞DNA复制起始的研究有一个专门的阶段呢?主要原因是真核细胞DNA复制起始过程非常复杂且高度调控,以保证我们基因组的稳定性。

真核细胞DNA复制起始研究的一个标志性的突破点是经过多年寻找终于在1992年找到了识别DNA复制源的蛋白——ORC(Origin Recognition Complex)。这个工作是美国冷泉港Bruce Stillman实验室完成的。90年代中期,实验室确定了真核细胞DNA复制起始的一个核心步骤是pre-RC (pre-replicative complex)的形成,pre-RC形成于细胞周期的G1期;同时也确定了ORC、Cdc6和MCM是pre-RC的组成成分。Cdc6是Leland Hartwell在1973年命名的,确定Cdc6的生物功能与DNA复制相关是后来许多实验室的工作。MCM(Mini-chromosome maintenance)复合体的亚基是1984年Bik Tye通过遗传筛选首先确定的,她的文章里也提到了MCM应该与DNA复制相关,直到90年代后期才证明MCM是DNA复制解旋酶,这个证明过程来自于许多实验室的工作,但业内还是认为MCM是Bik Tye发现的。2000年,Paul Nurse和Marcel Mechali实验室同时证明Cdt1也是pre-RC的成分,但Cdt1是David Beach在1994年首先发现的。在David Beach的文章里,有一个实验数据指出缺失Cdt1基因的裂殖酵母孢子,发芽后不能进入细胞的S期,猜测Cdt1的功能可能与DNA复制相关,但他并没有证明Cdt1是DNA复制蛋白。细胞不能进入S期,可以有很多原因。从1973年到2016年的43年时间里,研究总共确定了四个蛋白/酶是pre-RC的组分,即ORC、Cdc6/Cdc18、Cdt1和MCM;其中,ORC被认为是Bruce Stillman 实验室的发现,MCM被认为是Bik Tye实验室的发现。这四个蛋白在出芽酵母到人细胞,是非常保守的。DNA复制起始机制的研究主要是发现pre-RC的成分及它的装配机制。

在真核细胞DNA复制起始领域,有三个主要问题几十年里一直没有解决。它们是:1.从裂殖酵母到人细胞,pre-RC的装配机制没有阐明;2.从裂殖酵母到人细胞,DNA复制源的结构没有阐明;3.人细胞DNA复制源的位置,即DNA复制起始位点,一直没有在基因组范围内确定。第一个问题关系到对DNA复制起始机制的理解,第二和第三个问题关系到理解高等真核细胞如何选择DNA复制起始位点及如何能保证染色体DNA上的每一个片段在一个细胞周期内能被复制一次。

DNA复制起始蛋白Sap1功能总结

最近,孔道春教授研究组发现了一个新的DNA复制起始蛋白,它是pre-RC的一个必需组分,在裂殖酵母里叫Sap1蛋白。它在多细胞生物里的同源蛋白也已经被孔道春教授实验室找到。他们发现Sap1是一个DNA复制源结合蛋白,证明Sap1和ORC结合在DNA复制源上不同的位置,但Sap1和ORC在复制源上相互作用。研究组进一步证明Sap1是募集Cdc18(裂殖酵母里Cdc6的同源蛋白)到DNA复制源上的必需蛋白。孔道春教授和目前最好的足彩app金长文教授及南方科技大学汪涛副教授合作取得一系列进展:Sap1结合DNA的功能域的晶体结构得到阐明(汪涛老师实验室的工作);Sap1与DNA相互作用的生化机制通过核磁共振的方法得到阐明(金长文老师实验室的工作)。Sap1及其在高等真核生物同源蛋白的发现也阐明了裂殖酵母到人细胞的DNA复制源的结构。与出芽酵母不同,裂殖酵母和多细胞生物的DNA复制源结构由两个必需DNA序列决定,一个序列被ORC结合,另一个被Sap1结合。人细胞DNA复制源的全基因组位点也已经被孔道春教授实验室精确确定,文章待发表。

封面图片

DNA复制起始蛋白Sap1的发现将极大推进人们对真核细胞DNA复制起始机制的理解。该工作以cover article的形式发表于Journal of Biological Chemistry,292:6056-6075, Apr 14,2017。孔道春、金长文、汪涛三位老师是本文章的共同通讯作者。

原文链接:http://www.jbc.org/content/292/15/6056.abstract

编辑:山石

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